石門水庫才自6月1日起解除綠燈警戒，緊接著在梅雨鋒面與西南氣流交互作用下，集水區帶來豐沛雨量，水庫於昨6月3日晚上8時起開始調節性放水及洩洪，期間水庫水位更一度接近滿水位，所幸凌晨過後雨勢減緩，入流量下降，安全通過這場大豪雨考驗。
根據北水局資料顯示，自6月2日零時起，至今(4)日12時止，石門水庫集水區累積降雨達255.5毫米，水庫總進流量約1億噸、總放水量則為7500萬噸，水庫蓄水量淨增加2500萬噸；目前水位242.7公尺、蓄水量約1.8億噸、蓄水率90%，水庫水位較初始的239.3公尺，抬升了3.4公尺。
昨(3)日下午起由於梅雨鋒面北移，石門集水區開始有大量降雨，北水局自當日20時起即啟動調節性放水及洩洪機制，惟水庫水位仍快速上升，於當日午夜水位更高達244.9公尺，接近滿水位的245公尺。經過北水局人員努力審慎操作，啟用排洪隧道、溢洪道、永久河道放水口放水，並電廠滿載發電下，及兼顧下游淡水河兩岸橫移閘門關閉作業需要，終將水位控制於滿水位以下，最後因鋒面南移，而降雨減緩、水位下降，狀況順利解除。
根據北水局統計資料，本次洪水事件水庫最大入流量為每秒1428立方公尺、最大出流量為每秒1421立方公尺，為本(106)年初以來水庫最大之入流量與放流量，昨(3)日午夜水位244.9公尺，也是年初以來最高水位。北水局表示，目前水庫入流量已下降為約每秒400立方公尺，為了保留水庫蓄水量及維持適當調蓄空間，水庫放水量亦逐步調降，將視入流量調整放流量，目標將水庫水位控制於242公尺左右，以利維持防洪空間及穩定民生公共給水和農業二期稻作用水。